scikit
copy:
类型:bool,True或者False,缺省时默认为True。意义:表示是否在运行算法时,将原始训练数据复制一份。
若为True,则运行PCA算法后,原始训练数据的值不会有任何改变,因为是在原始数据的副本上进行运算;
若为False,则运行PCA算法后,原始训练数据的值会改,因为是在原始数据上进行降维计算。
whiten:
类型:bool,缺省时默认为False
意义:白化,使得每个特征具有相同的方差。关于“白化”,可参考:Ufldl教程
2、PCA的对象
components_ :返回具有最大方差的成分。 explained_variance_ratio_:返回 所保留的n个成分各自的方差百分比。 n_components_:返回所保留的成分个数n。 mean_: noise_variance_:fit()可以说是scikit-learn中通用的方法,每个需要训练的算法都会有fit()方法,它其实就是算法中的“训练”这一步骤。因为PCA是无监督学习算法,此处y自然等于None。 fit(X),表示用数据X来训练PCA模型。 函数返回值:调用fit方法的对象本身。比如pca.fit(X),表示用X对pca这个对象进行训练。 fit_transform(X) 用X来训练PCA模型,同时返回降维后的数据。 newX=pca.fit_transform(X),newX就是降维后的数据。
transform(X)
将数据X转换成降维后的数据。当模型训练好后,对于新输入的数据,都可以用transform方法来降维。 此外,还有get_covariance()、get_precision()、get_params(deep=True)、score(X, y=None)等方法,以后用到再补充吧。4、举例
以一组二维的数据data为例,data如下,一共12个样本(x,y),其实就是分布在直线y=x上的点,并且聚集在x=1、2、3、4上,各3个。
data array([[ 1. , 1. ], [ 0.9 , 0.95], [ 1.01, 1.03], [ 2. , 2. ], [ 2.03, 2.06], [ 1.98, 1.89], [ 3. , 3. ], [ 3.03, 3.05], [ 2.89, 3.1 ], [ 4. , 4. ], [ 4.06, 4.02], [ 3.97, 4.01]])
data这组数据,有两个特征,因为两个特征是近似相等的,所以用一个特征就能表示了,即可以降到一维。下面就来看看怎么用sklearn中的PCA算法包。
(1)n_components设置为1,copy默认为True,可以看到原始数据data并未改变,newData是一维的。
from sklearn.decomposition import PCA pca=PCA(n_components=1) newData=pca.fit_transform(data) newData array([[-2.12015916], [-2.22617682], [-2.09185561], [-0.70594692], [-0.64227841], [-0.79795758], [ 0.70826533], [ 0.76485312], [ 0.70139695], [ 2.12247757], [ 2.17900746], [ 2.10837406]]) data array([[ 1. , 1. ], [ 0.9 , 0.95], [ 1.01, 1.03], [ 2. , 2. ], [ 2.03, 2.06], [ 1.98, 1.89], [ 3. , 3. ], [ 3.03, 3.05], [ 2.89, 3.1 ], [ 4. , 4. ], [ 4.06, 4.02], [ 3.97, 4.01]])
(2)将copy设置为False,原始数据data将发生改变。
pca=PCA(n_components=1,copy=False) newData=pca.fit_transform(data) data array([[-1.48916667, -1.50916667], [-1.58916667, -1.55916667], [-1.47916667, -1.47916667], [-0.48916667, -0.50916667], [-0.45916667, -0.44916667], [-0.50916667, -0.61916667], [ 0.51083333, 0.49083333], [ 0.54083333, 0.54083333], [ 0.40083333, 0.59083333], [ 1.51083333, 1.49083333], [ 1.57083333, 1.51083333], [ 1.48083333, 1.50083333]])
(3)n_components设置为'mle',看看效果,自动降到了1维。
pca=PCA(n_components='mle') newData=pca.fit_transform(data) newData array([[-2.12015916], [-2.22617682], [-2.09185561], [-0.70594692], [-0.64227841], [-0.79795758], [ 0.70826533], [ 0.76485312], [ 0.70139695], [ 2.12247757], [ 2.17900746], [ 2.10837406]])
(4)对象的属性值
pca.n_components pca.explained_variance_ratio_ array([ 0.99910873]) pca.explained_variance_ array([ 2.55427003]) pca.get_params bound method PCA.get_params of PCA(copy=True, n_components=1, whiten=False)
我们所训练的pca对象的n_components值为1,即保留1个特征,该特征的方差为2.55427003,占所有特征的方差百分比为0.99910873,意味着几乎保留了所有的信息。get_params返回各个参数的值。
(5)对象的方法
newA=pca.transform(A)
对新的数据A,用已训练好的pca模型进行降维。
(6)设置参数
pca.set_params(copy=False) PCA(copy=False, n_components=1, whiten=False)
设置参数。
参考:
scikit-learn官网样例:scikit-learn.org/stable/modules/generated/sklearn.decomposition.PCA.html#sklearn.decomposition.PCA
博文:blog.csdn/u012162613/article/details/42192293、ishowcode/ai/ml/scikit-learn-pca/